ยับบา ดับบา ดู้ พบกับครอบครัวมนุษย์ยุคหิน เฟร็ด ฟลิ้นท์สโตน(จอห์น กู้ดแมน) ,วิลม่า ฟลิ้นท์สโตน(อลิซาเบธ เพอร์กินส์), บาร์นี รับเบิล(ริก มอรานิส) และ เบ็ตตี้ รับเบิล (โรซี่ โอ ดอนเนล) เรื่องราวของ เฟร็ด ผู้ได้รับตำแหน่งหน้าที่ใหญ่โตอย่างไม่น่าเชื่อ โดยได้ถูกย้ายจากพนักงานขับรถบรอนโตเครน ไปรับหน้าที่รองประธานใน สเลท แอนด์ คอมพานี แท้ที่จริงนั่นคือแผนชั่วจากผู้บริหารขี้โกง และลูกน้องคนสนิท ที่วางแผนใช้ เฟร็ด ให้กลายเป็นแพะรับบาปในแผนฉ้อโกงของพวกเขา